Na região do Douro encontram-se duas Zonas de Protecção Especial (ZPE) para as aves: a ZPE do Vale do Côa e a ZPE do Douro Internacional e Vale do Águeda.
São símbolos da região: o abutre-do-Egipto, a cegonha-preta, o grifo, o mocho-pequeno-d‘orelhas, o chasco-preto, a gralha-de-bico-vermelho, e o papa-figos.
Nesta região ainda se encontram algumas espécies criticamente ameaçadas de extinção tais como:
A fauna de mamíferos é também abundante, alguns dos quais também em risco de extinção, tais como: